（设备）高速基因分析仪

中文名称：高速基因分析仪

仪器型号：Ion torrent Ion S5

生产厂家：新加坡Thermo Fisher Scientific

购置时间：2017年

放置位置：医学科研实验中心---实验二区408房间

功能介绍：

未知物种全基因组测序，已知物种再测序，全基因表达组定量分析，全基因组小 RNA 分析，染色质免疫互沉淀（ChIP）研究,转录组分析，扩增子测序，定向重测序，人类全外显子组测序，神经疾病和肿瘤的精准诊断和治疗。

主要技术参数：

1.高数据通量：每次反应可生成 150 亿(15G)碱基数据；

2.每次运行可生成不少于 60M 个片段标签序列 reads 数，每个run 至少能做 2 个全外显子组测序；

3. 可以在 8.5 小时内完成样品制备、测序和数据分析，用于快速鉴定；

4.数据读长：单端读取序列，读长不低于400个碱基。Ion S5最新升级到600bp读长试剂盒；

5. 读取序列：单端读长不低于 400bp 或双端读长不低于 2x300 个碱基；

6.样品用量：DNA样本起始量仅需0.01ug（10ng），对于降解的样品、珍稀的样品尤其适合；

7.可精确读取≥6 个的连续单个重复碱基（如AAAAAA）；

8. 不同样品并行性：提供稳定成熟的 96 个样品的 index 混合接头；

9.可同时进行96个样品的12-6144重PCR产物的测序，单管里做的PCR重数越多，测序成本越低；

10.测序结果给出严格的 Q30 的数据；

11.采用边合成边测序的测序原理，可根据应用需求控制测序片段的长度；

12.提供简单优化的生物信息学支持软件：如新物种拼接，小RNA分析，扩增子分析，重测序，16S 宏基因组分析，文库质量 QC 等。