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高速基因分析仪
2020-11-03 08:58   审核人:

(设备)高速基因分析仪

中文名称:高速基因分析仪

仪器型号:Ion torrent Ion S5

生产厂家:新加坡Thermo Fisher Scientific

购置时间:2017

放置位置:医学科研实验中心---实验二区408房间

功能介绍:

未知物种全基因组测序,已知物种再测序,全基因表达组定量分析,全基因组小 RNA 分析,染色质免疫互沉淀(ChIP)研究,转录组分析,扩增子测序,定向重测序,人类全外显子组测序,神经疾病和肿瘤的精准诊断和治疗。

主要技术参数:

1.高数据通量:每次反应可生成 150 亿(15G)碱基数据;

2.每次运行可生成不少于 60M 个片段标签序列 reads 数,每个run 至少能做 2 个全外显子组测序;

3. 可以在 8.5 小时内完成样品制备、测序和数据分析,用于快速鉴定;

4.数据读长:单端读取序列,读长不低于400个碱基。Ion S5最新升级到600bp读长试剂盒;

5. 读取序列:单端读长不低于 400bp 或双端读长不低于 2x300 个碱基;

6.样品用量:DNA样本起始量仅需0.01ug10ng),对于降解的样品、珍稀的样品尤其适合;

7.可精确读取≥6 个的连续单个重复碱基(如AAAAAA);

8. 不同样品并行性:提供稳定成熟的 96 个样品的 index 混合接头;

9.可同时进行96个样品的12-6144PCR产物的测序,单管里做的PCR重数越多,测序成本越低;

10.测序结果给出严格的 Q30 的数据;

11.采用边合成边测序的测序原理,可根据应用需求控制测序片段的长度;

12.提供简单优化的生物信息学支持软件:如新物种拼接,小RNA分析,扩增子分析,重测序,16S 宏基因组分析,文库质量 QC 等。

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